Biointer test case for the Escrire project

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List all abstract from Medline which concern our annotations

It is now possible to access the Public MedLine data plus the Annotations provided by the Escrire project on these files:

Here are the ten pivotal annotations for the 10 basic papers:

• 90292349
• 89356624
• 90214629
• 91372157
• 88243016
• 91372136
• 90255388
• 88156967
• 88196080
• 90015118

For the record, one can have a look at the initial file provided by biologists of the annotathions of around 75 abstracts.

Queries

Here are some sample queries for this text case:

• Donner l'ensemble des documents parlant DU gène "bcd"
• Donner l'ensemble des documents parlant D'UN objet de type "gene" nommé "bicoid"
• Donner l'ensemble des documents parlant DE l'objet de type "gene" identifié par "bcd"
• Donner l'ensemble des documents parlant D'UNE interaction entre l'objet de type "gene" identifié par "gt" (giant) et l'objet de type "gene" identifié par "hb" (hunchback)
• Donner l'ensemble des documents ou l'objet de type "gene" identifié par "tll" (tailless) intervient dans une interaction (comme instigateur ou comme cible) classés par nom de l'autre objet de type "gene" participant à l'interaction
• Donner l'ensemble des documents ou les objets de type "gene" identifiés par "tll" (tailless) et "gt" (giant) sont instigateurs d'une interaction sur un meme objet de type "gene"

Related useful links

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• FlyBase
• Tambis
• Gene ontology
• Knife